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調(diào)控區(qū)域靶向捕獲甲基化測序技術(shù)

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產(chǎn)品型號

品       牌

廠商性質(zhì)經(jīng)銷商

所  在  地深圳市

聯(lián)系方式:經(jīng)理查看聯(lián)系方式

更新時間:2019-11-21 20:03:04瀏覽次數(shù):854次

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經(jīng)營模式:經(jīng)銷商

商鋪產(chǎn)品:7條

所在地區(qū):廣東深圳市

聯(lián)系人:經(jīng)理 (經(jīng)理)

產(chǎn)品簡介

調(diào)控區(qū)域靶向捕獲甲基化測序技術(shù)(LHC-Seq)是通過設計相應的探針序列,特異性捕獲感興趣的基因片段,捕獲序列進一步通過重亞硫酸鹽處理,高通量測序分析目標區(qū)域的甲基化水平。

詳細介紹

調(diào)控區(qū)域靶向捕獲甲基化測序技術(shù)(LHC-Seq)是通過設計相應的探針序列,特異性捕獲感興趣的基因片段,捕獲序列進一步通過重亞硫酸鹽處理,高通量測序分析目標區(qū)域的甲基化水平。該技術(shù)是大樣本量,固定區(qū)域甲基化檢測的優(yōu)選,可廣泛應用于臨床樣本甲基化特異性區(qū)域的鑒定以及與疾病相關(guān)的甲基化Bio-Marker的篩選和驗證。

調(diào)控區(qū)域靶向捕獲甲基化測序技術(shù)可服務的范圍如下:

  1. 常規(guī)芯片捕獲服務包括自主研發(fā)的全基因組啟動子及關(guān)鍵調(diào)控區(qū)域的芯片(promoter capture-BS)、全外顯子芯片(exome-BS)及NimbleGen的SeqCap Epi芯片等
  2. 個性化探針設計,可根據(jù)不同需要協(xié)助完成靶區(qū)域的探針合成及相關(guān)服務
  3. 提供單樣本雜交和多樣本混合后pooling雜交的服務策略,可*地降低實驗成本。
  4. 數(shù)據(jù)解讀分析內(nèi)容

  5. 數(shù)據(jù)產(chǎn)出、過濾和質(zhì)控
    • 下機數(shù)據(jù)過濾和質(zhì)控圖表,去污染、接頭
    • 統(tǒng)計reads長度,reads數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)產(chǎn)量
  6. 數(shù)據(jù)比對、甲基化信息
    • 比對結(jié)果、Bisulfite轉(zhuǎn)化率統(tǒng)計,捕獲效率統(tǒng)計
    • 目標區(qū)域內(nèi)覆蓋度以及覆蓋深度統(tǒng)計
    • 目標區(qū)域內(nèi)甲基化修飾位點及水平結(jié)果
  7. 甲基化修飾特征
    • 目標區(qū)域甲基化修飾水平的特征及統(tǒng)計
  8. 差異甲基化修飾區(qū)域
    • 差異甲基化修飾區(qū)域(DMR)的鑒定和注釋
  9. 差異甲基化修飾基因
    • 差異甲基化修飾基因功能和通路分析。
  10. 樣本要求

  11. 樣品類型:無降解,無污染的DNA樣品;
  12. 樣品需求量:單個樣本雜交的起始量大于3μg;多樣本混合雜交,每個樣本的基因組DNA量大于1.5μg。
  13. 樣品濃度:≥30 ng/μl;
  14. 樣品純度:OD260/280=1.8~2.0,不含蛋白和RNA等污染


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