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遺傳病的基因診斷

2011年01月12日 17:22上海紀(jì)寧實(shí)業(yè)有限公司點(diǎn)擊量:6742

根據(jù)出生缺陷監(jiān)測和殘疾兒調(diào)查結(jié)果顯示,我國是出生缺陷高發(fā)國家,每年有近100萬出生缺陷兒發(fā)生,30%在出生前后死亡,40%造成終生殘疾,只有30%可以治愈或糾正。在這些出生缺陷兒中,80%是由于遺傳因素造成的。如果能對這些患兒進(jìn)行癥狀前診斷或產(chǎn)前診斷,給予及時而適當(dāng)?shù)闹委熀皖A(yù)防,其經(jīng)濟(jì)和社會效益是不言而喻的。

目前我國幾個主要的醫(yī)學(xué)遺傳中心能檢測的基因診斷項目有20多種,包括唐氏綜合征(Down syndrome)、13三體(又稱Patau綜合征)、18三體(又稱Edwards綜合征)、地中海貧血(thalassemia)、甲型血友?。?hemophilia A )、進(jìn)行性肌營養(yǎng)不良(DMD/BMD)、 苯丙酮尿癥(phenylketonuria,PKU)、脆性X綜合征(fragile X syndrome)、馬凡氏綜合癥( Marfan syndrome)、Prader-Willi綜合征、脊髓性肌萎縮癥(spinal muscular atrophy, SMA )、軟骨發(fā)育不全(achondroplasia)、亨廷頓舞蹈?。℉untington disease , HD)、結(jié)節(jié)性硬化癥( tuberous sclerosis )、特發(fā)性無精癥(idiopathic azoospermia)、兩性畸形( hermaphroditism)、成人型多囊腎病(adult polycystic kidney dicease, APKD)、粘多糖貯積癥Ⅱ型( mucopolysaccharidosesⅡ,MPSⅡ)、遺傳性視神經(jīng)?。↙eber's hereditary optic neuropathy,LHON )、成骨不全 I 型( osteogenesis imperfecta,OI )、視網(wǎng)膜色素變性(retinitis pigmentosa)等。下面將我國發(fā)病率較高,導(dǎo)致出生缺陷危害較大的幾種遺傳病作一些簡單的介紹,在今后的專題中,我們將具體討論各主要遺傳病的基因診斷研究進(jìn)展。
1 染色體異常疾病
唐氏綜合征:在我國,新生兒中的平均發(fā)病率為1/750。唐氏綜合征胎兒的風(fēng)險隨著孕婦年齡的增加而升高。研究證明21號染色體特定的區(qū)域(q22.2片段)與該病典型的表現(xiàn)型有密切的關(guān)系,稱為唐氏綜合征關(guān)鍵區(qū)域(Down syndrome critical region,DSCR)。目前較普遍采用PAPP-A+AFP+hCG三聯(lián)法進(jìn)行篩查,而診斷中應(yīng)用較多的是FISH,但無法檢測易位型(約占5%)。其他的如同源基因半定量法、熒光定量PCR法等,已在一些實(shí)驗室中進(jìn)行。

另外兩種常見的非整倍體染色體異常:13三體和18三體,新生兒發(fā)病率分別為1/5000和1/1000。已有研究報道利用QF-PCR平臺,使用單管同時檢測21、13、18三條染色體上的12個STR位點(diǎn) ,根據(jù)等位基因片段的熒光強(qiáng)度比值直接診斷這三種常見的染色體病。這種方法同樣適用于性染色體異常的疾病,如Turner綜合征(占新生兒的1/5000)。

Prader-Willi綜合征:新生兒發(fā)病率1/10000,其機(jī)制是基因組遺傳印記效應(yīng)。在卵細(xì)胞減數(shù)分裂1期母源性15號染色體單親二體發(fā)生的染色體不分離導(dǎo)致Prader-Willi綜合征。對其關(guān)鍵區(qū)域基因SNRPN基因的DNA甲基化分析是對該病進(jìn)行診斷的zui準(zhǔn)確方法,可以將缺失、非平衡易位、單親二體和印記突變的所有病例檢測出來,敏感度高。
2 血液系統(tǒng)遺傳病
血液系統(tǒng)相關(guān)的遺傳病較多,以下列舉出國內(nèi)已經(jīng)開展產(chǎn)前診斷的幾種常見遺傳?。喊ǖ刂泻X氀?、G6PD缺乏癥及血友病。

地中海貧血是我國南方各省常見的遺傳疾病,發(fā)病率高,其基因研究深入,突變明確,是產(chǎn)前分子遺傳診斷的重點(diǎn),常見的有α地貧和β地貧。

α地貧: 兩廣地區(qū)(廣西和廣東)群體篩查攜帶者頻率分別高達(dá)14.95% 和8.3% 。我國α地貧的分子基礎(chǔ)主要是大片段基因缺失-SEA , -α3. 7 和-α4. 2 為zui常見的3 種基因缺失類型,非缺失型α 地中海貧血主要是Hb CS和Hb QS 。篩查方法有:紅細(xì)胞脆性單管法、平均紅細(xì)胞體積、鐵蛋白測定及血紅蛋白電泳等,根據(jù)各實(shí)驗室的條件而定,目前已有市售篩查試劑盒。分子診斷則是根據(jù)基因突變的類型,對缺失型和非缺失型分別采用不同的方法檢測。已有市售的裂口PCR(Gap-PCR)診斷試劑盒用于診斷缺失型;對于非缺失型,有研究人員設(shè)計出四引物等位特異性PCR,單管同時檢測我國常見的非缺失型Hb CS和Hb QS 。

β地貧:廣東省群體篩查攜帶者頻率為3.36% ,其分子基礎(chǔ)以點(diǎn)突變?yōu)橹?,中國已發(fā)現(xiàn)27種β-珠蛋白基因點(diǎn)突變 , 反向點(diǎn)雜交(reverse dot blot,RDB)是目前國內(nèi)外常用的檢測技術(shù),其優(yōu)點(diǎn)是可以同時篩查17種點(diǎn)突變,但操作稍復(fù)雜,使用探針的成本也較高。突變特異性擴(kuò)增(ARMS)法同時檢測多種已知點(diǎn)突變,可以應(yīng)用于國內(nèi)5種zui常見突變(約占90%)的篩查,該法簡便、經(jīng)濟(jì),易于推廣。

G6PD缺乏癥:是某些藥物性溶血、感染性溶血、蠶豆病及重癥新生兒黃疸發(fā)病的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。我國此病的流行病學(xué)特點(diǎn), 即:①基因頻率介于0. 0000~0. 4483之間 ,zui高的基因頻率發(fā)現(xiàn)于海南一苗族半隔離群; ②分布呈“南高北低”的趨勢。紅細(xì)胞G6PD活性測定是診斷本病的主要依據(jù),該技術(shù)簡單,通常用于篩查,特別是用于樣本較大的群體。G6PD基因突變具有高度的遺傳異質(zhì)性,現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)引起中國人G6PD缺乏癥的主要突變1376G→T、1388G→A、9 →G 三種,占已知基因突變的60 %~85.0 %, G6PD基因突變檢測zui常用錯配擴(kuò)增酶切法和ARMS法。

甲型血友病是FVIII基因突變導(dǎo)致的凝血功能障礙性遺傳病,呈X連鎖隱性遺傳,發(fā)病率為1/5000男性活嬰。目前國內(nèi)進(jìn)行基因診斷的方案采取三大步驟:首先看是否有倒位突變。內(nèi)含子22的倒位突變約占50%重型患者,因為擴(kuò)增的片段較長(>10kb),需要使用長片段PCR擴(kuò)增試劑盒。如果倒位陰性,第二步檢測二核苷酸重復(fù)(CA)n多態(tài);zui后使用RFLP進(jìn)行連鎖分析。這樣約90%以上的患病家系可以得到可靠診斷。目前我國僅有約5%的血友病患者得到明確診斷,開展該病的基因檢測,可以使更多的血友病患者避免創(chuàng)傷、更多的攜帶者接受產(chǎn)前診斷。
3 動態(tài)突變疾病
脆性X 綜合征:在常見的遺傳性智力低下疾病中,,發(fā)病率僅次于唐氏綜合征,占所有智力低下患者的2.6%~8.7% 。遺傳機(jī)制是由于FMR1基因中位于*個外顯子的(CGG)n重復(fù)序列異常擴(kuò)增而致病。診斷主要是用分子遺傳學(xué)方法,用PCR直接擴(kuò)增FMR1基因的(CGG)n重復(fù)序列或者使用甲基化敏感的內(nèi)切酶檢測甲基化狀況。應(yīng)對不明原因的智力低下兒童進(jìn)行大面積篩查,尤其是對有智力低下家族史的孕婦進(jìn)行產(chǎn)前篩查,以防止患兒出生。

亨廷頓?。罕静〉姆肿踊A(chǔ)是位于4p16.3的IT15基因編碼區(qū)多態(tài)性位點(diǎn)CAG重復(fù)序列增加超過其正常變化范圍所致。此多態(tài)CAG重復(fù)序列不穩(wěn)定,在親子傳遞中其重復(fù)次數(shù)可能會增加,尤其是經(jīng)父親傳遞,正常人群CAG重復(fù)次數(shù)為6-35,患者CAG重復(fù)次數(shù)超過40,甚至上千次。患者的臨床表現(xiàn)與CAG重復(fù)數(shù)不相關(guān),但其癥狀的嚴(yán)重程度和發(fā)病年齡與CAG重復(fù)數(shù)呈正相關(guān)。通過特異性的PCR和Southern 印記雜交能確定所有被檢測樣本CAG重復(fù)數(shù)。

遺傳性脊髓小腦性共濟(jì)失調(diào):是一系列常染色體顯性遺傳病,病變涉及腦干和脊髓,主要病理改變是小腦和其傳出和傳入系統(tǒng)的退行性病變。這些病的分子基礎(chǔ)是在位于不同染色體上的相關(guān)基因相關(guān)區(qū)域多態(tài)性位點(diǎn)CAG重復(fù)序列增加所致,除SCA10(ATTCT重復(fù))和SCA8(CTG重復(fù))。這些重復(fù)序列不穩(wěn)定,在親子代傳遞中其CAG重復(fù)序列可能會增加。通過特異的PCR擴(kuò)增和Southern 印記雜交可確定所有樣本的重復(fù)次數(shù)。
4 神經(jīng)、肌肉組織遺傳病
杜氏肌營養(yǎng)不良(DMD):X 連鎖隱性致死性遺傳病,發(fā)病率約占男性活嬰的1/3000。DMD基因突變以缺失為主,占50%~60%;重復(fù)突變次之,占5%~10%。分子遺傳學(xué)檢查是確診本病的主要手段,有以下幾種:應(yīng)用多重PCR可檢測95%以上的缺失突變,因為實(shí)驗簡單、快速、直接而成為。如果沒有檢測到缺失,而家系中又有先證者時,可以選用5~6個多態(tài)標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析來間接診斷。目前,應(yīng)用DHPLC (Denaturing High Performance Liquid Chromatography,變性液相色譜)技術(shù)進(jìn)行全基因外顯子突變篩查,可以使直接診斷率提高到95% 。應(yīng)用 RT-PCR分段擴(kuò)增,檢測DMD基因缺失、重復(fù)及剪接突變也在一些實(shí)驗室中進(jìn)行。

脊髓性肌萎縮癥:基因定位于5q12-13,嬰兒型的發(fā)病率在1/1萬左右,其突變基因的攜帶者比例高達(dá)1/50。分子診斷主要檢測SMN基因的缺失,應(yīng)用PCR-RFLP法診斷的準(zhǔn)確性相當(dāng)高,約90%的患者得以確診,成為目前臨床診斷的主要方法。另外,應(yīng)用定量PCR檢測SMN基因的重復(fù)拷貝數(shù),也是診斷該病的一個重要補(bǔ)充。
5 其 它
苯丙酮尿癥:是一種以智力低下為特征的先天性代謝缺陷,我國的平均發(fā)病率為1/16500,北方較南方發(fā)病率高?;蚨ㄎ挥?2q24.1,突變類型100余種,以點(diǎn)突變?yōu)橹?。我國大部分城市已開展新生兒篩查,主要采用細(xì)菌抑制法和干血片熒光分析法。產(chǎn)前診斷主要是針對突變熱點(diǎn)的外顯子進(jìn)行篩查,未查到突變,若家系中存在先證者,則利用基因的多態(tài)標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析。

Leber’s遺傳性視神經(jīng)?。菏?個已知與線粒體DNA點(diǎn)突變有關(guān)的人類疾病,好發(fā)年齡在12~30歲。目前已發(fā)現(xiàn)11種不同的線粒體DNA錯義突變與該病有關(guān),其中檢測兩種zui常見的突變可以診斷出約90%的患者。
6 結(jié) 語
目前迅速發(fā)展的分子生物學(xué)技術(shù)對已知突變基因檢測的特異度和敏感度都很高。因此,基因診斷是屬于診斷性檢查,所得到的結(jié)果常??梢宰鳛閦ui后確診的依據(jù)。理論上,任何胎兒細(xì)胞標(biāo)本都可以用于分子遺傳診斷。臨床上使用zui多的是未經(jīng)培養(yǎng)或經(jīng)過培養(yǎng)的羊水細(xì)胞,而絨毛細(xì)胞也是常用的標(biāo)本。絨毛細(xì)胞特別有利于早期診斷。由于分子遺傳診斷的敏感度非常高,所需要的標(biāo)本量少,而且能在孕早中期進(jìn)行診斷,是防止出生缺陷的重要手段之一。從事產(chǎn)前診斷的臨床醫(yī)生必須掌握不同的遺傳診斷方法的適用性以及不同遺傳病的致病機(jī)制,才能夠正確地應(yīng)用不同的遺傳診斷方法,為病人提供有助于診斷的遺傳信息,從而有效地干預(yù)出生缺陷, 優(yōu)化人口結(jié)構(gòu),提高國民的整體素質(zhì)。
 

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