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技術(shù)文章

柱式DNAback說明書

閱讀:379發(fā)布時間:2017-10-16

柱式DNAback

Column DNAback

 

產(chǎn)品及特點

試劑盒用于從瓊脂糖凝膠中或DNA反應(yīng)體系中(如PCR反應(yīng))回收DNA段。試劑盒采用可以、專一結(jié)合DNA的硅膠膜和*的溶膠體系,可以從瓊脂糖凝膠中或DNA反應(yīng)體系中快速回收DNA段,回收效率可達50-90%(跟片段大小相關(guān))。本產(chǎn)品的特點如下:

1. 回收效率zui高可達90%(跟片段大小和膠濃度等因素有關(guān)),可以跟國外廠家的產(chǎn)品媲美。

2. 快速,整個過程只需要十余分鐘。洗脫液不需要額外加乙醇。

3. 兩用,既可用于膠回收,也可以用于PCR或其他酶反應(yīng)回收。

4. 范圍廣,回收DNA的長度范圍為50 bp-40 Kb(但效率各不相同)。

5. 能回收單鏈、雙鏈及環(huán)狀DNA,zui大吸附量為10ug。

6. 回收的DNA可直接用于酶切、連接、PCR、測序等多種分子生物學(xué)實驗。

7. 本試劑盒足夠純化50片含DNA的瓊脂糖凝膠條(每片膠條重量不超過250mg,可以純化50次酶反應(yīng)(包括PCR反應(yīng),每次體積不超過250uL)。

 

規(guī)格及成分

 

編 號

50次大紙盒包裝

通用溶膠液2.0

170601

25 mL

吸附柱活化液

170602

25 mL

通用洗柱液

60408

50 mL

離心吸附柱(13層)

170606

50 套

DNA洗脫液3.0

170603

10 mL

使用手冊

60202sc

1份

 

 

運輸及保存

常溫運輸及保存,有效期為一年。由于通用溶膠液2.0是高鹽溶液,因此在低溫時容易產(chǎn)生沉淀。如果產(chǎn)生沉淀,需要60℃加熱溶解后才可以使用。

 

自備試劑

異丙醇

 

使用方法

一:對膠回收:

  • 用干凈的刀片切取含DNA段的瓊脂糖凝膠(100 mg左右,盡可能多地把多余的膠切除,否則會影響回收效率),放入一干凈的1.5 mL塑料離心管(自備)稱重,按重量比1:2的比例加入通用溶膠液2.0 (0.1 g瓊脂糖凝膠需要加入0.2mL的通用溶膠液2.0)。如果瓊脂糖凝膠的濃度大于2%,則需要按1:3的比例加入通用溶膠液2.0溶解膠塊。
  • 50℃保溫10分鐘使膠*溶化,每隔2-3分鐘振蕩數(shù)以促進瓊脂糖凝膠的溶化。如果片段長度在300bp以下,建議不要50℃保溫,而是延長溶膠時間,以免DNA變性,影響回收率。
  • 在等待期間,活化離心吸附柱。在離心吸附柱中加入0.5mL吸附柱活化液,套上收集管后室溫放置2分鐘,然后12,000 rpm離心2分鐘,倒棄穿透液,再將吸附柱套上收集管后待用?;罨蟮碾x心吸附柱必須在當(dāng)天使用。
  • 在上柱前,在溶化的膠中加入相當(dāng)于膠塊體積1/2的異丙醇(對100mg膠塊,加50uL),快速振蕩10秒混勻。
  • 將溶液轉(zhuǎn)移到離心吸附柱中,套上收集管,靜置3分鐘。注意:靜置有助于DNA與離心吸附柱的硅膠膜結(jié)合。本產(chǎn)品提供的離心吸附柱的zui大上樣體積為0.8mL,溶膠液的總體積大于0.8mL,一次加不完,可將溶液加入到吸附柱中。
  • 12000-15000 g離心1分鐘,倒掉收集管中的穿透液。
  • 加入0.7mL通用洗柱液于離心柱中,12000-15000 g離心1分鐘,倒棄收集管中的廢液如果回收的DNA用于鹽敏感實驗(如平末端連接或直接測序,建議加入通用洗柱液后靜置2-5分鐘再離心。
  • 12000-15000 g離心半分鐘去除離心柱中的殘留液體。
  • 將離心柱吸附置于新的干凈的塑料離心管(自備)中,懸空加入50 uL DNA洗脫液于離心吸附柱硅膠膜的*。注意:如果回收的DNA用于測序,則可用重蒸水(自備)洗脫DNA。DNA洗脫液可以也用TE替代,但用水或TE替代DNA洗脫液3.0時,回收率可能稍有降低。
  • 靜置3分鐘12000-15000 g離心1分鐘。
  • 離心管底部所得溶液即為純化的DNA溶液,可立即用于后續(xù)實驗或者放-20℃長期保存。如果將所得DNA溶液再次加回到離心吸附柱中,重復(fù)洗脫過程,將得到更多的DNA。
  • 用電泳方法或測OD方法確定回收所得DNA的濃度,1 OD260對應(yīng)的濃度是50ug/mL(對雙鏈DNA)或40ug/mL(對單鏈DNA),純凈DNA的OD260/OD280比值應(yīng)該在1.8左右。注意:OD讀數(shù)跟pH相關(guān),如果用自備的重蒸水洗脫,OD值會低于在DNA洗脫液3.0中測定的數(shù)字。

二:PCR或其他酶反應(yīng)回收

  • 直接在PCR或其他酶反應(yīng)中加2倍體積的通用溶膠液2.0,振蕩10秒混勻。如果PCR反應(yīng)中使用了石蠟,需要預(yù)先去除。
  • 活化離心吸附柱。在離心吸附柱中加入0.5mL吸附柱活化液,套上收集管后室溫放置2分鐘,然后12,000 rpm離心2分鐘,倒棄穿透液,再將吸附柱套上收集管后待用?;罨蟮碾x心吸附柱必須在當(dāng)天使用。
  • 在上柱前,在反應(yīng)液和溶膠液的混合液中加入相當(dāng)于反應(yīng)體積1/2的異丙醇(對100uL的反應(yīng)液,加50uL),快速振蕩10秒混勻。
  • 直接進入上面膠回收操作的第5步并進行后面的操作。

 

注意事項

1. 電泳回收DNA時,電泳緩沖液可以TAE、TBE或者本公司超快電泳液。回收效果為SuperBuffer-2,TAE次之,TBEzui差。

  • 通用洗柱液含有容易揮發(fā)物質(zhì),使用后一定要擰緊瓶蓋,密閉保存。
  • 瓊脂糖凝膠體積的大小與回收率成反比關(guān)系,即體積越大,越不利于回收,一次膠回收以使用100 mg瓊脂糖凝膠為宜。
  • 如果在5-10分鐘內(nèi)凝膠溶化不*,可以適當(dāng)?shù)难娱L水浴時間以使膠充分溶化,否則DNA包裹在瓊脂糖凝膠中,影響DNA的回收效率。
  • 膠溶化后的液體轉(zhuǎn)移到離心柱后,可以延長靜置時間使DNA與膜充分結(jié)合,提高回收效率。
  • 洗脫DNA前的空甩很重要,其目的是去除膜上殘留酒精,否則殘留酒精會影響后續(xù)DNA反應(yīng)。

7. 增大DNA洗脫液使用量有利于回收,但要注意實際上樣量與zui終回收體積的關(guān)系,以便于計算回收。DNA洗脫液可以用TE或水替代,但回收率稍有降低。

 

疑難解答

Q:為何用硅膠膜吸附柱法回收TBE膠中的DNA效果不好?

A:因為TBE中的硼酸會跟硅膠表面的OH基團反應(yīng),而這些OH又是吸附

DNA所必需的。

 

關(guān)聯(lián)產(chǎn)品

一管式膠回收試劑(CAT#:60706)、天恩澤超級電泳液(CAT#:151103)、綠如藍低毒核酸染料(CAT#:70303)


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