緩沖液配方的常見問題
閱讀:555發(fā)布時間:2016-11-3
緩沖液配方的常見問題
UU.轉膜后的脫脂奶粉封閉時,所用的防沫劑A是什么?還有Tris-HCl是不是就是用Tris和鹽酸配出來的呢?
解答:轉膜后的脫脂奶粉封閉液是5%的TBST脫脂奶粉。Tris-HCl就是Tris鹽用HCl調ph值,配置而成。
VV.準備做大鼠腦的WesternBlot,蛋白質位于細胞核中,請問此蛋白質的提取液及操作方法是?每一步都必須要低溫嗎?這種蛋白質是磷酸化的蛋白質,操作時如何防止去磷酸化的發(fā)生?
解答:可以用提取總蛋白的buffer提核蛋白,可以加NaF防止去磷酸化。
WW.想問一下細胞裂解液選擇蛋白酶抑制劑時有什么原則嗎?受不受組織來源的影響?胞膜和胞漿有區(qū)別嗎?
解答:一般來說提取時加入光譜的蛋白酶抑制劑就可以了,操作時保持低溫。除非有文獻特別指明用特殊的方法,一般來說都沒有區(qū)別。
XX.zui近作了兩次WesternBlot,不但沒陽性結果,顯色背景都沒有,電泳和轉膜都染過,有條帶。底片和顯色液及DAB顯色液均試過,沒問題。1、檢測GAD--分子量67kd,提取液有蔗糖,其余同三去污裂解液。蔗糖不會有影響把?樣本--20度放置一周內測。2、一抗放置2年,可能效價不高!用的是1:100。如果是一抗的原因,不會背景都沒有把?3、*次有不均勻背景,因為一抗過夜時密封袋不均勻。后兩次無背景顯色。4、封閉液用的是含15%脫脂奶粉TBST,漂洗液用的是含1%BSA的TBST液,TWEEN-20為0.1%,不會是封閉液的問題吧?
解答:可以在下面幾個問題上找找原因。1.封閉液用5%Milk,漂洗液(washingbuffer用TBST)2.看看一抗是否能work,降到1:20。3.看看二抗是否有問題。
YY.加甲醇的目的是什么?
解答:加甲醇起著一定的固定作用,因為小分子蛋白質容易轉出去.(特別是在硝酸纖維素膜上,因為NC膜結合蛋白質的能力較弱)。
ZZ.“轉膜后的脫脂奶粉封閉液是5%的TBST脫脂奶粉”,其中TBSTzui后那個T是Tween嗎,濃度多大?
解答:是Tween,配方如下:Tris-BufferedSalineTween-20(TBST),Dissolve8.8gofNaCl,0.2gofKCl,and3gofTrisbasein800mlofdistilledH2O,Add500ulofTween-20,AdjustthepHto7.4withHCl,AdddistilledH2Oto1L,Sterilizebyautoclaving.
AAA.封閉,一抗,二抗時的溫度有沒有什么規(guī)定呢,比如現(xiàn)在我就在室溫里做,或者要在4度下?
解答:均可在室溫進行,如果時間不夠,一抗孵育可以先在室溫進行一個小時,然后4度過夜。
BBB.實驗室暫無NP40我用sds可以嗎?另外有過用尿素和硫脲提取膜蛋白嗎?配方如下:7M尿素,2M硫脲,Triton-x-1000.2ml,新鮮加入:65mMDTT
蛋白酶抑制劑:試劑盒HaltTMProteaseinhibitorcocktailkit1%(v/v)
是用于抽提雙向電泳用蛋白的配方。不止用于抽提細胞全蛋白(主要是想得到其中的膜蛋白)是否可行?
改良的RIPA裂解緩沖液(Tris.HCl,50mmol/L,pH7.5;NaCl,150mmol/L;NP-40,1%;脫氧膽酸鈉,0.5%;SDS,0.1%;EDTA,1mmol/L;PMSF,1mmol/L;Leupeptin,2μg/ml)不知對于膜蛋白效果如何?此外該方中的EDTA,是否用做蛋白酶抑制劑?
解答:做2-D不推薦使用NP-40(因為即使進口的NP-40也不純,,其中的雜質會影響質譜結果)。對于動物細胞,其蛋白酶活性較弱(相對于組織和大腸桿菌等),可以不使用cocktail,因為7M尿素+2M硫脲+4%CHAPS構成的變性環(huán)境已經足以抑制大部分蛋白酶的活性,2M硫脲+4%CHAPS對于抽提膜蛋白有很大的幫助,不過如果您專職做膜蛋白建議采用分級抽提法。此外還可以采用梯度離心法和一些基于去垢劑的方法。EDTA用于滅活金屬蛋白酶(主要是其鏊合作用)。加過多的蛋白酶抑制劑可以導致蛋白質的修飾,做WB無所謂,做MAILDI時會給正確鑒定帶來麻煩。裂解緩沖液中少了兩性電解質(在2-D裂解緩沖液中,兩性電解質起的作用:提供連續(xù)的PH梯度,從很大程度上增加蛋白質的溶解性;還可以去除一部分核酸);也不推薦采用SDS,因SDS會與蛋白質結合導致其等電點發(fā)生改變,如果您實在要用,終濃度降到0.1%以下。
CCC.WesternStrippingBuffer的配方
解答:METHOD1
1、strippingbuffer:62.5mmol/lTrisPH6.7;100mmol/lbeta-mercaptoethanol;2%SDS
二次發(fā)光protocol:1.strippingbuffer洗膜:50度水浴30分鐘,搖床上搖10-20分鐘。
2、1*PBST洗:搖床上搖30分鐘。
3、封閉,加一抗,二抗(同*次發(fā)光)
METHOD2
?。?0ml總量):?-mercaptoethanol342μl;20%SDS5ml;Tris-ClpH6.73.125ml;加ddH2O至50ml。
方法:將用過的膜浸入strippingbuffer中,置50℃水浴箱中30min,間斷振搖。之后用TTBS洗3*5min就好。此時你已經可以按新的轉移好的膜來再次使用了。
該方法的優(yōu)點:省事,省力,省錢,符合慣例。
METHOD3
1、beta-metaptoethanol35ul
2、10%SDS1ml
3、tris(0.5M,pH6.7)625ul
4、dH2O3.34ml
50-55℃,30min。
METHOD4
strippingbuffer應該是可以放置很久的。不過我習慣于現(xiàn)配——畢竟,加了β-mercaptoethanol以后太難聞了,配了就用;而且,有了現(xiàn)成的Tris-HCl緩沖液和SDS的母液,現(xiàn)配還是很方便的。每次用量5ml少了點,我每次用50ml。
METHOD5
0.5MNaCl,0.5MHAc;室溫搖床15min。
METHOD6
將用過的膜泡在1*TBS中室溫振搖過夜,中間可以換液2-3次,然后封閉,加一抗,二抗(同*次發(fā)光),實踐證明方法*可行。
不管用那種方法,洗脫后都要用PBS或TBS再洗幾次。