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實(shí)驗(yàn)?zāi)康模悍蛛x蛋白質(zhì)混合物,將樣品進(jìn)行電泳后,為了不同目的在它的直角方向再進(jìn)行一次電泳。常說(shuō)的雙向電泳是根據(jù)蛋白質(zhì)所帶的電荷和分子大小對(duì)蛋白質(zhì)混合物進(jìn)行分離。
實(shí)驗(yàn)原理:*向等電聚焦的基本原理是利用蛋白質(zhì)分子或其他兩性分子的等電點(diǎn)不同,在一個(gè)穩(wěn)定的、連續(xù)的、線性的pH梯度中進(jìn)行蛋白質(zhì)的分離和分析。第二向運(yùn)用SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳根據(jù)分子量大小對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行分離。
基本過(guò)程:等電聚焦、平衡及轉(zhuǎn)移到二向、SDS-PAGE
試劑或儲(chǔ)液:IPG buffer、礦物油、DTT、碘代乙酰胺、過(guò)硫酸銨、TEMED、1M DTT、rehydration buffer、平衡液儲(chǔ)液、30%丙烯酰胺單體儲(chǔ)液、1.5M Tris-HCl、10% SDS、10X Tris-甘氨酸系統(tǒng)的電泳緩沖液、0.5%瓊脂糖、水飽和正丁醇、占位液
實(shí)驗(yàn)操作程序:
等點(diǎn)聚焦部分
1.根據(jù)選用的膠條的長(zhǎng)度計(jì)算上樣體積(見(jiàn)附1),加1M DTT到終濃度50mM需要的體積,補(bǔ)加IPG buffer到終濃度0.2%或者0.5%的體積,加rehydration buffer到該膠條的上樣體積。
2.把各種溶液按計(jì)算的體積加入到eppendorf管中,充分混勻,(或者超聲5-10min)14000rpm,10℃離心5min。
3.取出膠條室溫放置10min,平衡膠條的溫度。
4.沿著聚焦盤中槽的邊緣從左至右線性加入樣品。在槽兩端各1cm左右不要加樣,中間的樣品液一定要連貫。注意:不要產(chǎn)生氣泡,否則影響到膠條中蛋白質(zhì)的分布。
5.當(dāng)所有的蛋白質(zhì)樣品都已經(jīng)加入到聚焦盤中后,用鑷子輕輕的去除預(yù)制IPG膠條上的保護(hù)層。
6.分清膠條的正負(fù)極,輕輕地將IPG膠條膠面朝下置于聚焦盤中樣品溶液上,使得膠條的正極(標(biāo)有+,安瑪西亞膠條為)對(duì)應(yīng)于聚焦盤的正極(安瑪西亞為)。確保膠條與電極緊密接觸。不要使樣品溶液弄到膠條背面的塑料支撐膜上,因?yàn)檫@些溶液不會(huì)被膠條吸收。同樣還要注意不使膠條下面的溶液產(chǎn)生氣泡。如果已經(jīng)產(chǎn)生氣泡,用鑷子輕輕地提起膠條的一端,上下移動(dòng)膠條,直到氣泡被趕到膠條以外。
7.在每根膠條上覆蓋1-3ml礦物油,防止膠條水化過(guò)程中液體的蒸發(fā)析出尿素。需緩慢的加入礦物油,沿著膠條,使礦物油一滴一滴慢慢加在塑料支撐膜上。
8.對(duì)好正、負(fù)極,蓋上蓋子。設(shè)置等電聚焦程序(見(jiàn)附2)。
9.聚焦結(jié)束的膠條立即進(jìn)行平衡、第二向SDS-PAGE電泳,否則將膠條吸干礦物油置于平衡管中,-80℃冰箱保存。
注意事項(xiàng):
參見(jiàn)“雙向電泳培訓(xùn)班講義(定稿)”中等電聚焦注意事項(xiàng)部分。
附1:
膠條長(zhǎng)度、上樣量、上樣體積、等點(diǎn)聚焦的伏小時(shí)數(shù)的設(shè)置及說(shuō)明
膠條長(zhǎng)度
7cm
11cm
13cm
17cm
18cm
24cm
上樣體積
125ul
185ul
250ul
300ul
350ul
450ul
銀染上樣量范圍 pH3-10L(ug)
5-100
15-200
25-250
30-300
40-400
50-500
推薦使用量(ug)
50
100
125
150
200
250
銀染VHrs
12000
20000
24000
30000
36000
52000
考染上樣量范圍 pH3-10L(mg)
0.05-0.5
0.15-1.2
0.25-1.5
0.25-2.5
0.75-3
1-4
推薦使用量(ug)
250
500
650
750
1000
1250
考染VHrs
22000
30000
34000
40000
46000
62000
說(shuō)明:
1.pH3-10NL, pH4-7, pH6-11的上樣量與pH 3-10相比增加1.5-2倍,聚焦伏小時(shí)數(shù)延長(zhǎng)約10000VHr
2.按照推薦量上預(yù)實(shí)驗(yàn),根據(jù)預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果調(diào)整上樣量,樣品中蛋白質(zhì)分布均勻按推薦量使用,如果有高豐度的蛋白質(zhì)適當(dāng)降低上樣量,如果顯得少則適當(dāng)加大上樣量。聚焦的伏小時(shí)數(shù)可以根據(jù)聚焦的情況進(jìn)行調(diào)整。
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