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當(dāng)前位置:上海士鋒生物科技有限公司>>技術(shù)文章>>啟動子克隆方法研究進(jìn)展
隨著基因工程的發(fā)展,常常需要構(gòu)建一種能高水平表達(dá)異源蛋白質(zhì)的表達(dá)載體。啟動子對外源基因的表達(dá)水平影響很大,是基因工程表達(dá)載體的重要元件。因此研究啟動子的克隆方法,對研究基因表達(dá)調(diào)控和構(gòu)建表達(dá)載體至關(guān)重要。
迄今為止,國外尚未見到有關(guān)啟動子克隆方法的綜述性報道,國內(nèi)僅孫曉紅等曾就啟動子的結(jié)構(gòu)、分類、克隆方法和食用菌中已經(jīng)分離到的啟動子作過綜述。而近年來又有許多改進(jìn)的克隆啟動子的方法獲得了多方面的成功,本文就近年來改進(jìn)的啟動子克隆方法作一綜述,以期促進(jìn)對啟動子分離技術(shù)的應(yīng)用。
1 啟動子克隆的幾種方法
1.1 利用啟動子探針載體篩選啟動子
啟動子探針型載體是一種有效、經(jīng)濟(jì)、快速分離基因啟動子的工具型載體,包含2個基本部分:轉(zhuǎn)化單元和檢測單元。其中,轉(zhuǎn)化單元含復(fù)制起點和抗生素抗性基因,用于選擇被轉(zhuǎn)化的細(xì)胞;檢測單元則包括1個已失去轉(zhuǎn)錄功能且易于檢測的遺傳標(biāo)記基因以及克隆位點。
利用啟動子探針載體篩選啟動子的過程為,先選用1種適當(dāng)?shù)南拗菩院怂醿?nèi)切酶消化切割染色體DNA,然后將切割產(chǎn)生的DNA限制片段群體與無啟動子的探針質(zhì)粒載體重組,并按照設(shè)計的要求使克隆的片段恰好插在緊鄰報告基因的上游位置;隨后再把重組混合物轉(zhuǎn)化給寄主細(xì)胞,構(gòu)建質(zhì)粒載體基因文庫,并檢測報告基因的表達(dá)活性。
當(dāng)插入段同時滿足(1)具有基因啟動子序列;(2)具有翻譯啟始區(qū);(3)具有啟始密碼子;(4)插入方向正確;(5)插入片段3"端編碼區(qū)序列抗性基因編碼區(qū)讀碼框一致,則有可能形成有功能的抗性融合基因,從而啟動抗性基因的表達(dá)。
zui早由Rachael等在大腸桿菌中以四環(huán)素抗性基因作為報告基因構(gòu)建了啟動子探針質(zhì)粒pBRH3B,并克隆了一些原核和真核啟動子片段。其后Donna等以氯霉素抗性基因作為報告基因,F(xiàn)odor等以大腸桿菌LacZ為報告基因,構(gòu)建了酵母啟動子探針質(zhì)粒并克隆了一些啟動子片段。構(gòu)建啟動子探針型載體,較為常見的檢測標(biāo)記基因有β-半乳糖苷酶基因(lacZ)、氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶基因(cat)、四環(huán)素抗性基因(Tet")和卡那霉素抗性基因(Kan")。近年來,人們漸漸較多地使用潮霉素B磷酸轉(zhuǎn)移酶(hph)基因作為檢測標(biāo)記基因。李維等曾構(gòu)建了含有hph抗性基因的啟動子探針型載體pSUPV8,直接在大腸桿菌中分離黃孢原毛平革菌基因的啟動子。先用Sau3AI酶切黃孢原毛平革菌基因總DNA,再與用BamHI酶切后的pSUPV8相連,轉(zhuǎn)化大腸桿菌,用間接篩選法從氨芐青霉素和潮霉素抗性平板上篩選重組子,得到6個雙抗重組子(pCH1~pCH6),電泳檢測插入片段分別命名為CHl~CH6;再用原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化法將重組子分別轉(zhuǎn)化黃孢原毛平革菌,對獲得的轉(zhuǎn)化子進(jìn)行復(fù)篩,僅pCH6的轉(zhuǎn)化平板上有穩(wěn)定生長的菌落,說明了CH6片段在黃孢原毛平革菌中具有啟動基因表達(dá)的功能。該方法不需要知道具體基因的序列,可隨機(jī)篩選啟動子,避免了引物設(shè)計,能獲得大量的啟動子片段。
1.2 利用PCR技術(shù)克隆啟動子
即根據(jù)發(fā)表的基因序列,設(shè)計引物,克隆基因的啟動子,由于PCR法簡便快捷,近年來人們較多采用此方法克隆基因啟動子。
蘇寧等根據(jù)已報道的水稻葉綠體16SrRNA啟動子基因序列設(shè)計5"啟動子序列的引物,以水稻葉綠體DNA為模板,PCR擴(kuò)增出16SrRNA基因5"啟動子區(qū)的片段,酶切克隆到pSK的SacI和SphI位點,構(gòu)建測序載體質(zhì)粒pZ16S,進(jìn)行序列測定,結(jié)果表明所克隆的片段長為144bp,含有SD序列。同源比較結(jié)果表明,所克隆的片段與水稻葉綠體16SrRNA啟動子序列具有100%的同源性。
上述的PCR方法簡便、快捷、操作簡單,是人們較為廣泛使用的技術(shù)。
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