在從事細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的研究過(guò)程中我們常常需要探尋新的通路。在縱橫交錯(cuò)，紛繁復(fù)雜的cross-talk中如何篩選可能的路徑是signal transduction領(lǐng)域永恒的話(huà)題，而免疫共沉淀技術(shù)則是常用而簡(jiǎn)便的方法之一。

1.  免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）技術(shù)是以抗體和抗原之間的專(zhuān)一性作用為基礎(chǔ)的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。它能確定兩種蛋白質(zhì)在完整細(xì)胞內(nèi)生理性的相互作用。

2.  IP 利用抗原蛋白質(zhì)和抗體的特異性結(jié)合或細(xì)菌蛋白質(zhì)的“prorein A"特異性地結(jié)合到免疫球蛋白的FC 片段揭示待檢蛋白之間的相互關(guān)系。

以檢測(cè)某受體與JAK-STAT是否相關(guān)為例，實(shí)驗(yàn)前需要提前預(yù)測(cè)Receptor X可能與JAKs中的哪一個(gè)結(jié)合（激活）。然后用X受體的抗體去拉復(fù)合物，再用JAK的抗體去進(jìn)行WB檢測(cè)。如果兩種蛋白有相互作用，就會(huì)以復(fù)合物的形式存在于樣品中。需要了解的是，用A蛋白的抗體去沉淀A蛋白，這時(shí)候沉淀下來(lái)的可能是A蛋白，也可能是A和其他蛋白的復(fù)合體。

然后用B蛋白的抗體去檢測(cè)沉淀下來(lái)的樣品（WB），如果檢測(cè)到B蛋白，就說(shuō)明A蛋白和B蛋白是形成復(fù)合體的。具體的實(shí)驗(yàn)中，可以把A當(dāng)作受體把B當(dāng)做JAK，也可以反過(guò)來(lái)。與此同時(shí)，也應(yīng)該檢測(cè)受體激活的時(shí)候JAK-STAT是否同步激活，以及阻斷JAK-STAT以后受體的下游信號(hào)是否也被阻斷，這些都是證明可能存在的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的直接的證據(jù)。

3.  其優(yōu)點(diǎn)為：

（1）相互作用的蛋白質(zhì)都是經(jīng)翻譯后修飾的，處于天然狀態(tài)；

（2）蛋白的相互作用是在自然狀態(tài)下進(jìn)行的，可以避免人為的影響；

（3）可以分離得到天然狀態(tài)的相互作用蛋白復(fù)合物。

4.  其缺點(diǎn)為：

（1）可能檢測(cè)不到低親和力和瞬間的蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)相互作用；

（2）兩種蛋白質(zhì)的結(jié)合可能不是直接結(jié)合，而可能有第三者在中間起橋梁作用； 

（3）必須在實(shí)驗(yàn)前預(yù)測(cè)目的蛋白是什么，以選擇zui后檢測(cè)的抗體，所以，若預(yù)測(cè)不正確，實(shí)驗(yàn)就得不到結(jié)果，方法本身具有冒險(xiǎn)性。

5.  在免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)中要保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果的真實(shí)性，應(yīng)注意以下幾點(diǎn)：

（1）確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的，而并非外源非特異蛋白，單克隆抗體的使用有助于避免污染的發(fā)生；

（2）要確?？贵w的特異性，即在不表達(dá)抗原的細(xì)胞溶解物中添加抗體后不會(huì)引起共沉淀；

（3）確定蛋白間的相互作用是發(fā)生在細(xì)胞中，而不是由于細(xì)胞的溶解才發(fā)生的，這需要進(jìn)行蛋白質(zhì)的定位來(lái)確定。