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上海士鋒生物科技有限公司
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Pichia酵母表達(dá)系統(tǒng)使用心得

時間:2015/3/12閱讀:676
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甲醇酵母表達(dá)系統(tǒng)有不少優(yōu)點(diǎn),其中以Invitrogen公司的Pichia酵母表達(dá)系統(tǒng)zui為人熟知,并廣泛應(yīng)用于外源蛋白的表達(dá)。雖然說酵母表達(dá)操作簡單表達(dá)量高,但是在實(shí)際操作中,并不是每個外源基因都能順利得到高表達(dá)的。不少人在操作中會遇到這樣那樣的問題,收集了部分用戶在使用EasySelect Pichia Expression System這個被譽(yù)為zui簡單的畢赤酵母表達(dá)的經(jīng)典試劑盒過程中的心得體會。其中Xiang Yang是來自美國喬治城大學(xué)(Georgetown University)Lombardi癌癥中心(Lombardi Cancer Center),部分用戶來自國內(nèi)。

甲基酵母部分優(yōu)點(diǎn)與其他真核表達(dá)系統(tǒng)比較與原核表達(dá)系統(tǒng)比較
1.屬于真核表達(dá)系統(tǒng),具有一定的蛋白質(zhì)翻譯后加工,有利于真核蛋白的表達(dá)優(yōu)點(diǎn)-+
2.AOX強(qiáng)效啟動子,外源基因產(chǎn)物表達(dá)量高,可以達(dá)到每升數(shù)克表達(dá)產(chǎn)物的水平++++
3.酵母培養(yǎng)、轉(zhuǎn)化、高密度發(fā)酵等操作接近原核生物,遠(yuǎn)較真核系統(tǒng)簡單,非常適合大規(guī)模工業(yè)化生產(chǎn)。+++=
4.可以誘導(dǎo)表達(dá),也可以分泌表達(dá),便于產(chǎn)物純化。=+
5.可以甲醇代替IPTG作為誘導(dǎo)物,部分甲醇酵母更可以甲醇等工業(yè)產(chǎn)物替代葡萄糖作為碳源,生產(chǎn)成本低++++

+ 表示優(yōu)勝于;- 表示不如;= 表示差不多

EasySelect Pichia Expression System

產(chǎn)品性能:

優(yōu)點(diǎn)――使用簡單,表達(dá)量高,His-tag便于純化

缺點(diǎn)――酵母表達(dá)蛋白有時會出現(xiàn)蛋白切割問題

全面產(chǎn)品報(bào)告及心得體會:

巴斯德畢赤酵母(Pichia pastoris)是一種能表達(dá)重組蛋白的酵母品種,一方面由于其是屬于真核生物,因此表達(dá)出來的蛋白可以進(jìn)行糖基化修飾,另一方面畢赤酵母生長速度快,可以將表達(dá)的蛋白分泌到培養(yǎng)基中,方便蛋白純化。

畢赤酵母表達(dá)載體pPICZ在多克隆位點(diǎn)(MCR)3'端帶有his-tag和c-myc epitopes,這些tag有利于常規(guī)檢測和純化,而且在MCR5'端引入了alpha factor(α-factor)用以增加表達(dá),并且在表達(dá)后α-factor可以自動被切除。在進(jìn)行克隆的時候,如果你選擇的是EcoRI,那么只需在目標(biāo)蛋白中增加兩個氨基酸序列即可完成。另外pPICZ系列選用的是Zeocin抗生素作為篩選標(biāo)記,而誘導(dǎo)表達(dá)的載體需要甲醇――甲醇比一般用于大腸桿菌表達(dá)誘導(dǎo)使用的IPTG便宜。

*步――構(gòu)建載體

Xiang Yang:pPICZ系列有許多克隆位點(diǎn)可供選擇,同時也有三種讀碼框以便不用的用戶需要。

紅葉山莊:有關(guān)是選擇pPIC9K還是pPICZ系列?pPIC9K屬于穿梭質(zhì)粒,也可以在原核表達(dá),而pPICZ系列比較容易操作,大腸和畢赤酵母均用 抗Zeocin篩選(PIC9K操作麻煩一點(diǎn),大腸用amp抗性,而畢赤酵母先用His缺陷篩選陽性克隆,在利用G418篩選多拷貝),而且對于大小合適(30―50KD)的蛋白在產(chǎn)量上是pPIC9K*的。

leslie:要做畢赤酵母表達(dá)實(shí)驗(yàn),首先當(dāng)然就要了解這個可愛的酵母了(橢圓形,肥嘟嘟的,十分可愛),她和大腸桿菌長得有較大區(qū)別(大腸桿菌是桿狀的),因此在培養(yǎng)的過程中要區(qū)別這兩種菌體,除了氣味,濃度,顏色以外,也可以取樣到顯微鏡中觀測。大家做畢赤表達(dá)的時候應(yīng)該都遇過這種情況吧,表達(dá)過程中染菌(我們實(shí)驗(yàn)室曾經(jīng)污染過各種顏色形狀的細(xì)菌,那真是一段可怕的經(jīng)歷),如果在不知情的情況下繼續(xù)做下去,那可以就是浪費(fèi)大把的時間了。

基本熟悉了畢赤酵母,了解了她生長的喜好(多糖偏酸環(huán)境),生長的周期等等情況后,當(dāng)然更多的精力還是應(yīng)該花在表達(dá)的目的蛋白上,我的表達(dá)蛋白有些恐怖,有100KD,本來當(dāng)然應(yīng)該放在大腸桿菌中表達(dá),但是為了分泌表達(dá)(其實(shí)后來發(fā)現(xiàn)大腸桿菌pET系列分泌表達(dá)系列也不錯)和糖基化修飾(主要是這個方面,因?yàn)槲业牡鞍资侨嗽吹?,表達(dá)出來用于酵母雙雜,因此需要有完備的糖基化修飾)。這樣我的DNA片段由于較長,所以在做克隆的時候也要非常小心,需要注意的是:

①酶切位點(diǎn)不能出現(xiàn)在目的DNA段中――如果片段長無法避免,可以采用平末端連接;

②雖然α-factor可以自動切除,但是在設(shè)計(jì)表達(dá)的時候,如果在N端不能出現(xiàn)任何多余的aa(比如藥物蛋白表達(dá)),需要特別留意(說明書上有詳細(xì)說明:P13);

③有三種不同的讀碼框(對于pPICZα系列來說就是對上α-factor序列),在設(shè)計(jì)克隆的時候要反復(fù)確定自己的讀碼框是否正確,這可是致命的問題;

④無論pPICZ還是pPICZα都有TGA(終止密碼子),但是pPICZ系列沒有ATG(起始密碼子),有人認(rèn)為酵母啟動子與外源基因的ATG之間的距離越短對于表達(dá)的該基因越有利;

⑤如果不希望有c-myc和His-tag,可以在基因片段末尾加入終止密碼子;

⑥Pichia的密碼子與釀酒酵母的相似,有關(guān)基因表達(dá)偏好密碼子的問題有人認(rèn)為沒有必要更換,有人認(rèn)為一定要換,個人認(rèn)為以產(chǎn)量為主要目的的可以考慮更換基因密碼子,而如果片段過長就比較麻煩,不過有許多真核保守蛋白其實(shí)是和酵母密碼子相似的;

⑦克隆菌株需要有recA,endA,試劑盒帶有的*0挺好用的(其它像是DH5α都行),但是要注意帶有篩選抗生素Zeocin的培養(yǎng)基要用低鹽培養(yǎng)基(NaCl減半),這主要是因?yàn)榕掠绊懙娇股刈饔茫╖eocin平板要避光保存);

⑧測序引物可以用α-factor信號引物,也可以用5'AOX1引物;

⑨如果需要高量表達(dá),可以考慮做克隆的時候串聯(lián)基因片段進(jìn)行表達(dá),另外也可以在轉(zhuǎn)化酵母的時候重復(fù)轉(zhuǎn)化。

⑩目的基因中不要含有pro-glu-ser-thr這樣的序列,因?yàn)檫@個序列是激活蛋白水解酶的作用底物,會影響表達(dá),另外也不要含有x-phe-x-arg-gln和gln-arg-x-phe-x這樣的序列(x=任何氨基酸),因?yàn)檫@些序列容易受到容酶體的切割,而且目的蛋白末端是ala,asp,val,ser這樣的氨基酸。除此之外許多高A+T含量的基因通常會由于提前終止而不能有效轉(zhuǎn)錄,也需要多加注意。

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